印度尼西亚早在14世纪时已在爪哇开始养殖遮目鱼，已开始在池塘养殖遮目鱼、鲶、非鲫、青鱼、草鱼、鲢、鳙以及罗氏沼虾和对虾等，稻田养鱼也有较久的历史。南亚印度在这一地区的水产养殖发展最快，1980年养殖产量达40万吨,居世界第4位。过去仅利用废弃盐田养鱼，运河两岸都以池塘混养印度产的四种鲤科鱼类，并获得高产。此外也引进中国的青鱼、草鱼、鲢、鳙和非鲫等，还大量养虾。东亚除中国外，日本是这一地区水产养殖最发达的国家之一，也是整个亚洲的重点地区。日本的水产养殖采用封闭循环温流水高密度养殖系统，在湖泊和近海以网箱和围拦大面积精养鱼类，并在贝类养殖方面采用浮筏式垂挂养殖法等先进技术，产量大幅度上升。主要养殖对象为鲷、鳗、鲤、虹鳟、对虾、牡蛎、紫菜及珍珠、扇贝、鲍等海珍品，其中海水珍珠产量占世界首位。