海藻糖是一种天然的糖类，存在于许多沙漠植物中，在植物干枯时形成一层玻璃状的基质，保护其内部结构，直至雨水来到，植物可奇迹般地起“死”而复生。在其它水产加工品如白干鱼片、干鱼产品中加入海藻糖，能有效抑制鱼干在保存及运输中的褐变、保持色泽白净，同时还具有抑制腥臭味和防止褐变的作用，使产品口感柔软且富有弹性、味道鲜美、也便于长时间冷冻保存。
与麦芽糖、蔗糖和葡萄糖相比，海藻糖具有较高的玻璃化转变温度。这使得海藻糖可以在很高温度下保持活性蛋白的稳定性，以避免其在热加工中的失活。这种特性能使海藻糖在糖果中具有较广阔的应用空间。同时又由于海藻糖的低吸湿性和不褐变性，使加入了海藻糖的硬糖和软糖褐变程度低，并有良好的保形性。
海藻糖具有稳定生物膜（细胞膜）和蛋白质结构及抗干燥的作用，为其应用展示了广阔的前景。海藻糖应用于生物制品保护。另外，海藻糖具有抑制骨胶原分解的作用，因而可用于改善骨质疏松症。海藻糖还可用来保存研究用生物制品，如基因工程的酶类及其它酶类、细胞膜、抗体、抗原、细胞器等，食品加工,精细化工等。