饲料原料是加工饲料的基础，选择原料先要保证原料的90%来源于已认定的绿色食品产品及其副产品，其他可以是达到绿色食品标准的产品;其次，要注意选购消化率高、营养变异小的原料。据测定，选择高消化率的饲料至少可以减少粪尿中5%氮的排出量。再次是要注意选择有毒有害成分低、安全性高的饲料，以减少有毒有害成分在畜禽体内累积和排出后的环境污染。饲料加工的精准程度对畜禽的消化吸收影响很大，不同的畜禽对饲料加工的要求是不一样的。采用膨化和颗粒化加工技术，可以破坏和抑制饲料中的抗营养因子、有毒有害物质和微生物，改善饲料卫生，提高养分的消化率，使粪便排出的干物质减少三分之一。
对轻微霉变饲料的处理：
1.辐射或暴晒法。对轻微霉变的原料用辐射或暴晒的办法处理，可破坏其中50%-90%的黄曲霉毒素。
2.酶解法。利用酶的专一亲和性，高效催化、降解黄曲霉毒素为无毒化he物。酶降解去除霉菌毒素效果好、实用性强，但酶易被高温或酸度所破坏且分解后的产物还可能有毒，因此需要注意。
3.吸附法。常用的吸附剂有沸石、活性炭等，这类吸附剂添加量大，有的有副作用，有的还吸附养分和抗生素。另一类是酵母细胞壁类产品。
4.物理化学法。利用中草yao熏蒸法，氧化剂法，乳酸菌和醋酸菌等微生物法，或补充硒等营养元素可降低黄曲霉毒素毒性。由于处理后仍有毒素残留，应限量饲喂，并添加黄菌霉毒素吸附剂。