洁净室施工质量控制可以分为3个阶段：即准备阶段、施工阶段和验收阶段。
验收阶段质量控制要点：净化空调系统的调试工作是工程验收阶段不可少的一项重要工作。通过调试可以及时发现施工中存在的一些缺陷并及时进行整改和修补，调试对设计图纸也是一个重要的验证过程。
洁净室和空调送回风管道应在安装高效过滤器前达到清洁要求，净化空调系统必须连续空吹12小时以上，空吹后再对送回风管和空调机组内部进行清扫和擦洗干净。
工程竣工后，建设单位应组织医疗部门、使用洁净室的相应科室、设计和施工单位依照工程设计文件和《医院洁净手术部建筑技术规范》 (gb50333-2013)、《通风与空调工程施工验收规范》(gb50243-2002)和《洁净室施工及验收规范》(jgj71-90)等有关施工 质量验收规范对洁净室进行严格的质量验收，并应委托有资质的第三方检测单位对洁净室内洁净度对照设计文件和有关标准规范进行检测。
负压手术室解决方案：为伴有传染病的患者手术时，应建立负压洁净手术室。方法：应采取增设排风机等有效手段以调节排风量，使洁净手术室由正压变成负压。结果：在洁净区域内用空气负压差来控制气流，吸收有害气体，洁净室内空气。结论：使用负压手术室可以从根本上控制和解决手术室空气污染问题。
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