饲料原料是加工饲料的基础，选择原料先要保证原料的90%来源于已认定的绿色食品产品及其副产品，其他可以是达到绿色食品标准的产品;其次，要注意选购消化率高、营养变异小的原料。据测定，选择高消化率的饲料至少可以减少粪尿中5%氮的排出量。再次是要注意选择有毒有害成分低、安全性高的饲料，以减少有毒有害成分在畜禽体内累积和排出后的环境污染。饲料加工的精准程度对畜禽的消化吸收影响很大，不同的畜禽对饲料加工的要求是不一样的。采用膨化和颗粒化加工技术，可以破坏和抑制饲料中的抗营养因子、有毒有害物质和微生物，改善饲料卫生，提高养分的消化率，使粪便排出的干物质减少三分之一。
饲料发霉实际上是霉菌大量生长和繁殖的结果，而霉菌在饲料中生长和繁殖需要1定的温度和湿度。饲料中常见的霉菌有：曲霉菌属、青霉菌属和镰刀菌属。其中大部分属于温性型微生物，较适生长温度一般为22-30℃。其中曲霉菌属较适生长温度为30℃左右，青霉菌属为25℃左右，镰刀菌属为22℃左右。上述几种霉菌对环境湿度要求较高，较适的相对湿度在80%以上。因此，霉菌的生长和繁殖与地区气候条件和季节密切相关。从全国范围来说，南方地区和华中地区大大高于北方地区。我国南方地区，5-9月份平均气温均在22℃以上，相对湿度在80%以上，这种高温高湿的环境条件，特别是梅雨季节，霉菌生长繁殖较为旺盛，饲料霉变大多发生在这个季节。长期的梅雨季节导致空气湿度在85%以上，环境温度在22-30℃，在这种条件下霉菌大量生长繁殖，导致饲料发霉的情况非常普遍，给饲料厂、经销商以及养殖户造成严重的经济损失。