目前，焚烧炉在患病害的动物尸体无害化处理以及医疗废弃物、有毒有害固体废弃物处理方面有较大的应用价值。
以动物的焚烧为例，说明利用焚烧炉进行无害化处理的操作步骤：
1、注入燃料，接通电源，启动助燃开关，炉内温度达到自燃温度，将病害畜禽肉尸及其产品投入炉内，关闭助燃开关，启动自燃开关，病害肉体保持自燃状态不能剖割的病害畜禽尸体整体投入焚烧炉中，启动自燃开关，尸体自燃至完全碳化为止。
2、整尸焚毁：不能剖割的病害畜禽尸体整体投入焚烧炉中，启动自燃开关，尸体自燃至完全碳化为止。
3、肉尸分割焚毁：允许分割的病害肉品分割后投入焚烧炉中，启动自燃开关，肉块自燃至完全碳化为止。
4、脏器焚毁：病害畜禽脏器整体投入焚烧炉中，启动助燃开关，使脏器在助燃状态下燃烧至完全碳化为止。
5、焚烧后的碳化物需要选择地点（远离水源地和居民区）进行掩埋，彻底杜绝病菌的传播
下表说明了垃圾焚烧装置各部件的行程和速度的设计值，供运行人员参考：
油缸位置
调整值
正常值
设计范围
行程
油缸规格
油缸数量
料斗挡板门
开启速度/关闭速度
开：20s
关：20s
速度恒定
590mm
ø90xd50xs600
2
料斗破桥系统
正常运行时间（指一个完整的往复运动）
破桥缸：
开120s
关120s
液压缸速度调整后恒定
破桥缸：
1400mm
ø80xd45xs1400
2
锁定缸：
开20s
关20s
锁桥缸：100mm
ø40xd22xs100
1
给料机
同上
60秒（实际运动时间50s，端点停10s）
40秒-160秒（行程为300mm的情况下）
900mm（启动时）200~500mm（正常运行）
ø125xd80xs920
3
逆推炉排主驱动系统
同上
90秒（实际运行时间80秒，端点停10秒）
60秒-240秒
420mm
ø200xd100xs440
3
逆推炉排尾部料层调节系统
同上
往复180s-240s
油缸速度调整后恒定
445mm
ø80xd45xs445
2
顺推炉排
同上
90秒（实际运行时间80秒，端点停10秒）
60秒-240秒
250mm
ø90xd50xs260
6
出渣机
同上
135秒
90秒-360秒
650mm
ø125xd80xs670
2
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