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凝胶迁移或电泳迁移率实验(emsa-electrophoreticmobilityshiftassay)是一种研究dna结合蛋白和其相关的dna结合序列相互作用的技术,可用于定性和定量分析。这一技术最初用于研究dna结合蛋白,目前已用于研究rna结合蛋白和rna序列的相互作用,已经成为转录因子研究的经典方法。
当蛋白质与末端标记的核酸探针结合后,sds–page电泳时这种复合物比无蛋白结合的探针在凝胶中泳动的速度慢,即表现为相对滞后,用于检测dna结合蛋白、rna结合蛋白,并可通过加入特异性的抗体(supershift)来检测特定的蛋白质,也可进行未知蛋白的鉴定。
应用方向:
目前,emsa已用于研究rna结合蛋白和特定的rna序列的相互作用,已经成为转录因子研究的经典方法。
1、用于研究特定的转录因子以及转录因子所结合的顺势作用元件。
2、用于研究与蛋白质相结合的dna的序列的特异性。
3、评估突变对探针dna与结合蛋白相互作用的影响。
说明:
1、细胞核蛋白或纯化的转录因子(部分实验亦可使用重组表达的蛋白),依据实验设计至少提供50ul,浓度大于0.5mg/ml。
2、探针序列,如无探针序列,请提供dna结合蛋白相关信息或相关文献,便于技术人员设计探针。
3、需结合蛋白特异性抗体或由我公司代买。
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曲玲
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