目前各方都在积极探讨光伏扶贫工程存在的问题以及困难，主要集中以下几个方面：一是正在开展贫困户的识别工作，如何调动贫困户积极性问题；二是政府资金有限，如何解决融资渠道问题；三是小范围试点对电网冲击不大，如何应对大面积推广带来的电网安全和消纳问题；四是用户模式和小型电站模式的分散性特点带来维护问题，如何保证20-25年长期稳定收益；五是项目分散量小，如何做好把控项目质量，采集项目信息，发放项目补贴及配套相应政策等项目管理问题。
虽然这项工程有一些困难，但光伏扶贫工程的目的明确：有效促进贫困地区农民增收就业、开发经济摆脱贫困。如何才能达到这一目的，如果单纯从扶贫或者能源的角度去看，任何结论都是相对片面的。应该综合考虑光伏产业和农村农民的各个层面因素，挖掘光伏扶贫的潜力，做好这项工程建设和管理，才能实现长期稳定收益。