集装箱运输信息系统设计的总体目标，是利用先进的计算机技术和网络通信技术，建设高质量、高效率的集装箱运输信息系统网络，以促使集装箱运输链条内各个节点的信息系统互通互联，最大限度地实现信息资源共享，同时汇集各业务系统的信息，服务于各级管理指挥和科学决策，通过各种业务信息的综合分析，提供最佳决策支持，从而推动集装箱运输领域更好地组织运输生产和进行经营管理。集装箱信息系统的设计原则主要体现在以下几个方面：实用性、可靠性、安全性、先进性、标准性、可扩展性、开放性、实时性、便捷性、经济性。
集装箱运输信息系统的建设，就是通过信息技术和信息产品的应用，达到在更高层面支撑集装箱运输业务运作的目的。从信息系统的角度来看，业务就是集装箱运输的专业知识与操作流程，而技术则是实现集装箱运输信息系统的基础，是服务于信息化全过程的所有可能的it手段。
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