公元325年，地球上首次出现了医院这种医疗形式，随之而来的医院感染也就产生了，但对其认识确是一个漫长的过程。19世纪产褥热在欧洲是人所共知的致死性疾病。Holmes首次提出是由医生带给产妇的感染，这是对医院感染的首次认识。很多年以后，19世纪中叶Lister才阐明细菌与感染之间的关系，并首次提出了消毒概念，其著名外科无菌操作制度的论文发表于1867 年。南丁格尔创始了目前还在使用的无菌技术，医院感染才得到有效控制。Florey在20世纪40年代发现了青霉素，开始了抗生素的时代。随着耐药菌株的产生，使耐甲氧青霉素金葡菌引起了世界性流行，曾一度成为医院感染的突出问题。直到最近医务人员才采取了无菌技术和抗生素有效结合来处理感染问题。

在现代的社会中，随着医学的发展、治疗手段的增加、抗生素的大量使用及不合理应用，造就了一大批免疫力低下的人群，增加了病人的易感性和内源性感染，给抗感染治疗带来困难，为了有效的控制医院感染，40余年来，各国的医学工作者相继做了大量的临床和研究工作，从不同角度探索切实可行的方法，在降低医院感染发病率、节约卫生资源、造福于病人等方面取得了可喜的成果。